oligonucleotide คืออะไร?

oligonucleotide เป็นห่วงโซ่สั้นของโมเลกุล DNA หรือ RNA ที่มีการใช้งานมากมายในชีววิทยาโมเลกุลและการแพทย์มันถูกใช้เป็นโพรบในการคัดกรองโรคการติดเชื้อไวรัสและเพื่อระบุยีนในการทดลองทางชีววิทยาโมเลกุลนอกจากนี้ยังใช้เป็นไพรเมอร์ในการจัดลำดับดีเอ็นเอชนิดหนึ่ง

ในการทำความเข้าใจ oligonucleotide มันช่วยให้เข้าใจโครงสร้างของ DNAโมเลกุลดีเอ็นเอเป็นขดลวดยาวมากของสองเส้นทำจากสี่หน่วยฐานนิวคลีโอไทด์ที่แตกต่างกันจัดเรียงตามคำสั่งซื้อที่แตกต่างกันแต่ละหน่วยมีฐานเสริมที่มันจะผูกดังนั้นแต่ละเส้นจะมีชุดเบสตรงข้ามที่มีผลผูกพันฐานเหล่านี้สามารถสร้างชุดค่าผสมที่หลากหลายและเป็นการรวมกันของฐานที่ให้รหัสพันธุกรรมDNA ถูกถอดความเพื่อผลิต Messenger RNA (mRNA) ซึ่งถูกแปลเพื่อผลิตโปรตีน

oligonucleotides ถูกระบุด้วยความยาวโซ่ของพวกเขาตัวอย่างเช่น oligonucleotide ที่มีฐานนิวคลีโอไทด์สิบฐานยาวจะเรียกว่า

สิบ mer โดยทั่วไปจะถูกสังเคราะห์ทางเคมีและประเภทของการสังเคราะห์ จำกัด ความยาวของโซ่ให้น้อยกว่า 60 เบสยาว

ในการเรียงลำดับดีเอ็นเอประเภทที่เรียกว่า

dideoxy sequencing , oligonucleotides ถูกใช้เป็นไพรเมอร์เพื่อให้เอนไซม์ที่ทำให้เอนไซม์DNA จะมีเทมเพลตให้ทำงานมีการใช้ดีเอ็นเอที่มีเกลียวเดี่ยวและ oligonucleotide ที่เสริมกับ DNA strand นั้นถูกสังเคราะห์โดยใช้เครื่องอัตโนมัติDNA polymerase ที่สังเคราะห์ DNA ยังคงเพิ่มลงบนไพรเมอร์และสังเคราะห์เส้นตรงข้ามของ DNA จากมันปฏิกิริยานี้ก่อให้เกิด DNA ที่มีเส้นสายสองเท่า

การใช้ oligonucleotides เมื่อเร็ว ๆ นี้เนื่องจากไพรเมอร์อยู่ในปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส (PCR) ที่ใช้เพื่อขยายชิ้นส่วนเล็ก ๆ ของ DNAเทคนิคนี้มีการใช้งานจริงเช่นในการทดสอบทางนิติเวชและการทดสอบความเป็นพ่อนอกจากนี้ยังมีการปฏิวัติการวิจัยด้านการแพทย์และวิทยาศาสตร์ชีวภาพเนื่องจากมักใช้ในการทดลองทางวิศวกรรมพันธุกรรม

ชุดของโพรบ oligonucleotide มักจะใช้ในการแยกยีนจากห้องสมุดของยีนหรือ DNAs เสริม (CDNAs)ไลบรารี cDNA ประกอบด้วย DNA ที่มีเส้นสายสองเท่าซึ่งหนึ่งเส้นนั้นได้มาจาก mRNA strand และอีกเส้นหนึ่งเป็นส่วนเสริมของมันห้องสมุดดังกล่าวมีข้อได้เปรียบที่พวกเขาไม่มีช่องว่างที่พบบ่อยในยีนจากสิ่งมีชีวิตที่สูงขึ้น

โครงสร้างของยีนจากสิ่งมีชีวิตจำนวนมากเป็นที่รู้จักหากต้องการโคลนยีนจากสิ่งมีชีวิตอื่นเราสามารถเห็นสิ่งที่เป็นที่รู้จักเกี่ยวกับยีนในสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ และการออกแบบโพรบตามพื้นที่ส่วนกลางในลำดับเหล่านั้นจากนั้นนักวิจัยจะมีชุดของโพรบ oligonucleotide ที่สังเคราะห์ซึ่งคำนึงถึงการเปลี่ยนแปลงที่เป็นไปได้ในพื้นที่ส่วนกลางพวกเขาคัดกรองห้องสมุดด้วยโพรบเหล่านั้นและมองหา oligonucleotides ที่ผูกยีนจำนวนมากได้รับการระบุในลักษณะนี้

oligonucleotide antisense มี antisense antisense มี strand เดียวของ RNA หรือ DNA ที่เป็นส่วนประกอบของลำดับที่น่าสนใจเมื่อการเข้ารหัสยีนเฉพาะสำหรับโปรตีนถูกโคลนแล้ว antisense RNA มักใช้เพื่อป้องกันการแสดงออกของมันโดยการจับกับ mRNA ที่จะสังเคราะห์สิ่งนี้ช่วยให้นักวิจัยกำหนดผลกระทบต่อสิ่งมีชีวิตเมื่อไม่ได้สร้างโปรตีนนั้นAntisense oligonucleotides ยังได้รับการพัฒนาเป็นยาชนิดใหม่ในการปิดกั้น RNA ที่เป็นพิษ

ชิป microarray เป็นอีกพื้นที่หนึ่งที่ oligonucleotides เป็นยูทิลิตี้ที่ยอดเยี่ยมเหล่านี้คือสไลด์แก้วหรือเมทริกซ์อื่น ๆ ที่มีจุดที่มีโพรบดีเอ็นเอหลายพันตัว mdash;ในกรณีนี้ทำจาก oligonucleotidesพวกเขาเป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพมากในการทดสอบการเปลี่ยนแปลงของยีนต่าง ๆ ในครั้งเดียวDNA นั้นถูกผูกไว้กับสารประกอบที่เปลี่ยนสีหรือฟลูออเรสเซสหาก DNA เสริมผูกกับมันดังนั้นจุดเปลี่ยนสีหากมีปฏิกิริยากับทดสอบ DNA

บางสิ่งบางอย่าง oligonucleotide microarrays ใช้สำหรับรวมถึงการตรวจคัดกรองโรคทางพันธุกรรมตัวอย่างเช่นมีโพรบขนาดเล็กที่แสดงถึงกิจกรรมของยีนที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งเต้านม BRCA1 และ BRCA2 เป็นไปได้ที่จะพบว่าผู้หญิงมีการกลายพันธุ์ในยีนเหล่านี้หรือไม่และวิเคราะห์เพิ่มเติมเพื่อดูว่าเธอมีความโน้มเอียงสำหรับมะเร็งเต้านมหรือไม่

มี microarray ที่เรียกว่า virochip ที่มีโพรบประมาณ 20,000ยีนจากไวรัสที่ทำให้เกิดโรคต่างๆที่ได้รับการจัดลำดับการหลั่งของร่างกายเช่นเสมหะสามารถวิเคราะห์ด้วยชิปซึ่งมักจะสามารถระบุประเภทของไวรัสที่ติดเชื้อไวรัสการระบุการติดเชื้อไวรัสอาจเป็นเรื่องยากเนื่องจากอาการมักจะคล้ายกับไวรัสชนิดต่าง ๆ